Случаят се отнася до разследване, започнало през 2016 г., във връзка с договор за ремонт на изтребителите МиГ-29. Прокуратурата твърдеше, че като министър Ненчев е нарушил закона, избирайки Полша за партньор по ремонта вместо руския производител, с което целенасочено е нанесъл вреди за над 48,5 млн. лева на руската компания „РСК МиГ“.
Впоследствие Ненчев бе оправдан на три съдебни инстанции. Още в мотивите на първата инстанция съдия Петър Стоицев подчерта, че Ненчев е действал в интерес на страната и не е извършил престъпление, а е „избрал по-малкото зло“, сключвайки по-изгоден договор. Съдът изтъкна също, че външната политика на България се определя от Министерския съвет и не подлежи на съдебен контрол.
Процесът продължи над четири години, като прокуратурата обжалваше всяка от оправдателните присъди. Според Ненчев това го е поставило в изключително тежка емоционална ситуация – чувства се унизен, сразен професионално и политически, а отношенията с близките му се влошили. В подкрепа на твърденията му са разпитани неговата дъщеря и близка от БЗНС.