Според прокуратурата още като шеф на дирекция "Управление на доставките" в Министерството на отбраната Цонев е нарушил Закона за обществените поръчки при подписването на контракти за доставка на авточасти и на 183 тона месни консерви и свинско месо.
Срещу Цонев бе заведен иск от МО почти един милион лева 970 653 лева за нанесените щети, който бе последователно отхвърлен и от трите съдебни инстанции.
Разследването на тези договори първоначално бе прекратено от военната прокуратура заради липса на данни за престъпление, но след идването на ГЕРБ на власт през 2009 г. то бе изтупано от прахта и стартира със „страшна сила”, с каквато и се сгромоляса.
От решението на ВКС си личи, че обвинението не е имало никакъв шанс да издържи. Върховните съдии посочват, че "безспорно е установено, че с изключение на последната процедура за двата двигателя за товарен автомобил, подготовката на останалите е започнала много преди встъпването на подсъдимия Цонев първоначално на длъжността директор на дирекция "Управление на доставките"-МО със значително "по-свити" правомощия".
"Заявките за министерството са били подадени още в края на 1998 г. и обсъдени и обобщени от съответните родове войски, като съобразно тях са били предложени съответните разходи в бюджета на МО, като това впоследствие е намерило отражение и в предмета на провежданите процедури на държавни поръчки от МО", приемат още върховните съдии.
Междувременно стана ясно, че до месец се очаква втора оправдателна присъда на ексминистъра да влезе в сила, след като прокуратурата се отказа да поддържа обвиненията срещу него по делото му за неправомерно увеличаване на капитала на държавното дружество "Терем" ЕАД. Две съдебни инстанции оправдаха Цонев по това дело и отхвърлиха исковете срещу него-
Той бе оневинен и по делото, че е ощетил държавата с 8 млн. лв., като е сключил неизгодна сделка за купуването на поточна линия за строителство на хангари.
На първа инстанция все още се точи делото срещу Цонев за предлагане на подкуп на следователя Петьо Петров, по което бившият министър е подсъдим заедно със съдия Петър Сантиров и ексглавния секретар на финансовото министерство Тенчо Попов.